明治村の北口（SL東京駅）から中央部（SL名古屋駅）の間に蒸気機関車牽引による列車が運転されています。在籍する機関車は9号と12号の二両で，いずれも動態保存です。 　12号機関車は明治7年英国製，日本で初めて鉄道の走った新橋−横浜間に投入された機関車の一つで，動態保存されている蒸気機関車では国内最古となります。12号の機番は明治44年に尾西鉄道に移った際に称されたようです。9号機関車は明治44米国製で，富士身延鉄道，日本鋼管鶴見製鉄所で働いてきた古豪です。いずれも昭和49年から明治村で動態保存が続けられているとのことです。通常は9号機関車が運用に就いている様子です。

　蒸気機関車に牽引される客車は三両ですが，こちらも実際に明治生まれの貴重な客車達です。ハフ11は明治41年製で青梅鉄道，高畠鉄道，雄勝鉄道（羽後交通雄勝線）を渡り歩いてきた車両で，ロングシートの閉鎖デッキ車両です。ハフ13・14は明治45年製で，新宮鉄道，鉄道省，そして雄勝鉄道を渡り歩いた車両で，開放デッキが特徴です。いずれも昭和48年に明治村へやってきたとのことで，現在も元気に活躍しています。

　機関庫はSL東京駅側にありますが，転車台は両端の駅にあり，列車が着く度に転回シーンを見学することができます。

　その他，鉄道省新橋工場の建物内に6号御料車と5号御料車の二両が保存されています。6号は明治天皇用に，5号は昭憲皇太后用に用意されたもので，6号は珍しい３軸ボギー車となっています。なお車両の見学は車両外部だけではなく，プラスチック板に覆われた通路を介して内部の見学も出来るようになっています。